Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms