Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sfrp1Q8C4U3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfrp1Q8C4U3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfrp1Q8C4U3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfrp1Q8C4U3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sfrp1Q8C4U3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sfrp1Q8C4U3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfrp1Q8C4U3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms