Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Snx16Q8C080 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx16Q8C080 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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