Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam53cQ8BXQ8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam53cQ8BXQ8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms