Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Iffo1Q8BXL9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Iffo1Q8BXL9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Iffo1Q8BXL9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Iffo1Q8BXL9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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