Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trerf1Q8BXJ2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms