Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ube3dQ8BX13 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms