Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdcl3Q8BVF2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdcl3Q8BVF2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdcl3Q8BVF2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdcl3Q8BVF2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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