Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8BP99 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Q8BP99 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8BP99 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8BP99 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8BP99 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8BP99 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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