Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms