Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp4f39Q8BGU0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp4f39Q8BGU0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms