Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Susd6Q8BGE4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms