Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q8BGC1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q8BGC1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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