Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim19Q80ZU4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms