Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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