Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crb2Q80YA8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms