Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Zbed4Q80WQ9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed4Q80WQ9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms