Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrrc1Q80VQ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lrrc1Q80VQ1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrrc1Q80VQ1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrrc1Q80VQ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lrrc1Q80VQ1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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