Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rims3Q80U57 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms