Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pja2Q80U04 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms