Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NischQ80TM9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
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