Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms