Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms