Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms