Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
March6Q6ZQ89 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms