Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot1Q6ZQ08 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms