Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tfap2eQ6VUP9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms