Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms