Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc154Q6RUT8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms