Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trak1Q6PD31 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms