Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Herc4Q6PAV2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms