Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AtminQ6P9S1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms