Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms