Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgb4Q6P8W9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgb4Q6P8W9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms