Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarca2Q6DIC0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms