Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nop58Q6DFW4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms