Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6DFW0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms