Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sv2cQ69ZS6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sv2cQ69ZS6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms