Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Surf4Q64310 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms