Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20809Q62458 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms