Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nptx1Q62443 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nptx1Q62443 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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