Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl12Q62401 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms