Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms