Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd180Q62192 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms