Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1aQ61495 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms