Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usf1Q61069 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usf1Q61069 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms