Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift20Q61025 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ift20Q61025 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms