Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms