Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncor1Q60974 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ncor1Q60974 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms