Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a4Q60857 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms